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Les tubes internes de ces organismes ne contenaient pas de chitine, le principal composant des parois cellulaires des champignons, mais des substances similaires à la lignine, que l’on trouve dans le bois. Il est intéressant de noter qu’ils se nourrissaient de matière organique en décomposition, ce qui est caractéristique des champignons, plutôt que d’extraire leur nourriture de l’air, comme les plantes.
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L’équipe a donc conclu que les Prototaxites devaient être considérés comme des représentants d’eucaryotes précédemment non décrits et comme un exemple d’organismes d’un règne inconnu.